PayPayは、さらに安全安心に「PayPay」を利用してもらうため、PayPayアプリ バージョンv3.57.0以降においてクレジットカードの本人認証サービス「3Dセキュア2.0（EMV 3Dセキュア）」に対応した。
「3Dセキュア2.0」では、契約しているクレジットカード会社にあらかじめ登録した通知先などでワンタイムパスワードを受け取り、本人認証を行う。
登録したパスワードで本人認証を行う従来の3Dセキュア1.0と比較し、パスワード忘れなどの心配がなく、より安全かつスムーズに本人認証を行うことが可能となる。
利用中のクレジットカードが同本人認証サービスに対応しているかの確認および本人認証サービスの設定方法などについては契約するクレジットカード会社ごとに異なるとのこと。
なお、3Dセキュア1.0での認証は順次終了予定となっている。
